Peamine erinevus - DNA ligaas vs DNA polümeraas
DNA ligaas ja DNA polümeraas on olulised ensüümid, mis on seotud organismide DNA replikatsiooni ja DNA parandamise mehhanismidega. DNA ligaas vastutab DNA fragmentide ühendamise eest, katalüüsides fosfodiestersidemete moodustumist nukleotiidide vahel. DNA polümeraas vastutab DNA sünteesi eest selle ehitusplokkidest (nukleotiididest), kasutades matriits-DNA-d. See on peamine erinevus DNA ligaasi ja DNA polümeraasi vahel.
SISU
1. Ülevaade ja peamine erinevus
2. Mis on DNA ligaas
3. Mis on DNA polümeraas
4. Võrdlus kõrvuti - DNA ligaas vs DNA polümeraas
5. Kokkuvõte
Mis on DNA ligaas?
DNA ligaasi on ensüüm, mis katalüüsib fosfodiester sideme 3 '- OH ja 5'- PO 4 rühmad nukleotiidi ning lihtsustab liitmisega DNA fragmente. Seda tuntakse ka kui molekulaarset õmblust. See võime võimaldab täita lünki või DNA-d ja ühendada DNA replikatsiooni käigus tekkinud Okazaki fragmendid. DNA ligaasid on rekombinantse DNA tehnoloogias rekombinantsete DNA molekulide tootmiseks väga kasulikud. DNA ligaas ühendab huvipakkuva DNA vektor-DNA-ga. Seetõttu on see organismide jaoks oluline ensüüm.
DNA ligaasi ensüüm sõltub selle funktsioonist kofaktorist ja Mg2 + ioonidest. On kaks kofaktorit, mis aitavad DNA ligaase. NAD + toimib bakteriaalsete DNA ligaaside kofaktorina, samas kui ATP toimib sageli kofaktori viiruse ja eukarüootsete DNA ligaasidena. Eukarüootse DNA ligaasi toime lõpeb kolme peamise etapiga.
Etapp 01. DNA ligaas ründab ATP molekuli ja vabastab pürofosfaadi (kaks fosfaatrühma) ja AMP ning moodustab ligaasi-adenülaadi vaheühendi, seondudes kovalentselt saadud AMP-ga.
Etapp 02: Moodustatud ensüümi AMP vaheaine kannab AMP nikli 5'-fosfaati ja moodustab DNA - adenülaadi (DNA-ahela 5'-fosfaat-hapnik ründab ligaasi-adenülaadi vaheühendi fosforit).
Etapp 03: DNA ligaas katalüüsib nikli 3'-OH rünnakut DNA-adenülaadil polünukleotiididega liitumiseks ja vabastab AMP.
DNA ligaasid eraldatakse tavaliselt T4 bakteriofaagist ja kasutatakse laialdaselt rekombinantse DNA tehnoloogias.
Joonis 01: DNA ligaas nikeparanduses
Mis on DNA polümeraas?
DNA polümeraas on üldlevinud ensüüm, mida leidub kõigis organismides, mis osalevad DNA sünteesis ja genoomi replikatsioonis. Geneetiline teave läheb DNA polümeraaside abil vanematelt järglastele. See katalüüsib olemasoleva DNA jaoks uue komplementaarse DNA sünteesi. DNA polümeraas lisab nukleotiidid (nukleiinhapete ehitusplokid) praimerjärjestuse 3'OH rühma ja jätkab ahela moodustumist 5 'suunas. Enamikul DNA polümeraasidel on korrektuuriks 5 'kuni 3' polümeraasi aktiivsus ja 3 'kuni 5' eksonukleaasi aktiivsus.
Prokarüootseid DNA polümeraase on kirjeldatud viies suuremas rühmas. Eukarüoodid sisaldavad vähemalt 16 erinevat DNA polümeraasi. Kõik need DNA polümeraasid on rühmitatud seitsmesse perekonda, nimelt A, B, C, D, X, Y ja RT (pöördtranskriptaas).
Joonis 02: DNA polümeraasiga juhitud DNA replikatsioon
Mis vahe on DNA ligaasil ja DNA polümeraasil?
Erinev artikkel keskel enne tabelit
DNA ligaas vs DNA polümeraas |
|
| DNA ligaas on ensüüm, mis katalüüsib fosfodiestersidemete moodustumist nukleotiidide vahel ja ühendab DNA fragmendid omavahel. | DNA polümeraas on ensüüm, mis katalüüsib DNA sünteesi nukleotiidide abil. |
| Roll DNA replikatsioonis | |
| DNA ligaas on täiendav ensüüm DNA replikatsioonis, mis ühendab Okazaki fragmente. | DNA polümeraas on DNA replikatsiooni peamine ensüüm. |
| Nõuded | |
| See sõltub Mg 2+ ioonidest ja ATP / NAD + kofaktoritest | See sõltub matriitsist, nukleotiididest, praimeritest ja Mg 2+. |
| Funktsioonid | |
| DNA ligaas on oluline DNA rekombinatsiooni, DNA parandamise ja replikatsiooni jaoks. | DNA polümeraas on oluline DNA replikatsiooni, DNA parandamise ja DNA rekombinatsioonitehnoloogia jaoks. |
Kokkuvõte - DNA ligaas vs DNA polümeraas
DNA ligaas on oluline ensüüm, mida on vaja DNA fragmentide ühendamiseks fosfodiestersidemetega. DNA polümeraas on peamine DNA uue sünteesi jaoks oluline ensüüm. Peamine erinevus DNA ligaasi ja DNA polümeraasi vahel on nende funktsioon. Mõlemad ensüümid on aga hädavajalikud DNA parandamiseks, DNA replikatsiooniks ja rekombinantse DNA tehnoloogia jaoks.
