Golgi kehade ja mitokondrite peamine erinevus seisneb nende täidetavas funktsioonis. Golgi kehade (või Golgi aparaatide) põhiülesanne on valkude modifitseerimine, sorteerimine ja pakkimine sekreteerimiseks, samal ajal kui mitokondrite peamine ülesanne on raku energiavaluuta (ATP) tootmine hingamise kaudu.
Eukarüootsed rakud sisaldavad rakulisi organelle nagu Golgi kehad, mitokondrid, lüsosoomid, ribosoomid, tuum jne. Need on raku funktsioonide jaoks vajalikud elutähtsad organellid. Golgi kehad on osa endomembraansüsteemist, mis koosneb vesiikulitest ja volditud membraanidest, samas kui mitokondrid on topeltmembraaniga seotud oakujulised organellid, mida leidub eukarüootsetes rakkudes.