Peamine erinevus glükogeeni ja glükoosi vahel on see, et glükogeen on polüsahhariid, mis salvestab süsivesikuid loomades ja seentes, samas kui glükoos on kõige rikkalikum monosahhariid, mis toimib rakkudes esmase energiaallikana.
Süsivesikud on orgaanilised ühendid, mida iseloomustavad süsiniku, vesiniku ja hapniku elemendid. Vesiniku ja hapniku suhe on 2: 1 süsivesikutes, sarnaselt veega. Süsivesikud on väga olulised laialt levinud bioloogilised ühendid, kuna need on peamine energiaallikas ja protoplasma struktuurne koostisosa. Üldiselt on süsivesikud valged, tahked ja orgaanilistes vedelikes lahustuvad, välja arvatud teatud polüsahhariidid. Monosahhariidid on süsivesikute molekulide põhiühikud ja glükoos on neist kõige olulisem. Glükogeen on ka süsivesik. Kuid see on polüsahhariid, mis moodustub glükoosi molekulide anaboliseerumisel hargnenud molekuliks. Nii glükoos kui ka glükogeen on olulised keha energiatootmisel. Glükoos on peamine energiatootmise kütus ja glükogeen on teatud liik sekundaarset,pikaajaline energiasalvestus loomadel ja seentel.
