Peamine erinevus funktsionaalse rühma ja asendaja vahel on see, et funktsionaalne rühm on molekuli aktiivne osa, samas kui asendaja on keemiline liik, mis võib asendada molekulis aatomi või aatomite rühma.
Termineid funktsionaalne rühm ja asendaja leidub sageli orgaanilises keemias. Funktsionaalne rühm on teatud tüüpi asendaja, mis põhjustab molekuli aktiivsust. See tähendab, et teatud molekuli reaktsioonid määratakse funktsionaalse rühma järgi. Asendaja võib olla aga kas aktiivne või mitteaktiivne keemiline liik.