Peamine erinevus anammoksi ja denitrifikatsiooni vahel seisneb selles, et anammoks viitab anaeroobsele ammooniumi oksüdeerimisele, mis muundab ammooniumi ja nitritid anoksilistes tingimustes gaasiliseks lämmastikuks. Vahepeal kaasas denitrifikatsiooni on bioloogilist muundamist tijast N 2 järgi denitrifitseerivate bakterid.
Lämmastikuringet on oluline Aineringe milles lämmastik muundatakse erinevad keemilised vormid, nagu NH 3, NH 4 +, NO 2 -, NO 3 -jne. Lämmastikuringes on neli peamist protsessi. Need on fikseerimine, ammonifitseerimine, nitrifikatsioon ja denitrifikatsioon. Paljud neist protsessidest viivad läbi mikroorganismid, eriti mullas olevad bakterid. Anammox on üks viimaseid täiendusi lämmastiku tsüklis. See on anaeroobse ammooniumi oksüdatsiooni protsess. Konkreetne bakterite rühm, mida nimetatakse planctomycetes, viib selle protsessi läbi. Neil on spetsiaalne organell, mida nimetatakse anammoksosoomideks ja mis annab koha anamoksoreaktsiooniks. Kuid lõpuks tekitavad nii denitrifikatsioon kui ka anammoks gaasilist lämmastikku.
