Peamine erinevus alfa- ja beeta-anomeeride vahel on see, et alfa-anomeeris on anomeerse süsiniku juures olev hüdroksüülrühm anisomeerikeskuses eksotsüklilise hapniku suhtes cis, samas kui beeta-anomeeris on hüdroksüülrühm trans-eksotsükliliseks hapnikuks.
Anomeer on süsivesikute geomeetriline variatsioon. See on epimeeri tüüp, milles võime näha anomeerset süsinikuaatomit. Anomeerne süsinikuaatom on tuletatud süsivesikute avatud ahela struktuuriga karbonüülsüsinikust. Seetõttu nimetatakse tsüklilise struktuuri moodustumist avatud ahela struktuurist anomeriseerumiseks.