Peamine erinevus Whatmani filterpaberi ja tavalise filterpaberi vahel on see, et Whatmani filterpaber sobib kvalitatiivseks analüüsiks, samas kui tavalised filterpaberid sobivad nii kvalitatiivseks kui ka kvantitatiivseks analüüsiks.
Filtreerimine on segu erinevate komponentide eraldamise tehnika. Selle eraldamise jaoks võime kasutada filterpabereid. Seetõttu kasutame seda tõkkena, mis on risti kas vedeliku- või õhuvooluga. Seega on need filterpaberid kasulikud kvalitatiivse või kvantitatiivse analüüsi jaoks. Whatmani filterpaber on kvalitatiivse analüüsi jaoks spetsiifiline.