Peamine erinevus prostaglandiini E1 ja E2 vahel on see, et prostaglandiin E1 (PGE1) on põletikuvastane tegur, samas kui prostaglandiin E2 (PGE2) on põletikku soodustav tegur.
Prostaglandiinid on lipiididest saadud ühendid, millel on hormoonitaoline funktsioon. Need võivad toimida autokriinsete või parakriinsete ühenditena, põhjustades elusorganismides antagonistlikku või sünergistlikku toimet. Prostaglandiin E1 ja prostaglandiin E2 on kahte tüüpi ja need erinevad põletiku funktsionaalsuse poolest. Nii prostaglandiin E1 kui ka E2 kuuluvad samasse prostaglandiini E2 perekonda ning nende reaktsioonialus ja mõju pole veel täielikult välja selgitatud. Neid kasutatakse elusolendite erinevate biokeemiliste mehhanismide ravis.