Peamine erinevus klorofülli A ja B vahel on see, et klorofüll A on taimede ja vetikate peamine fotosünteesiv pigment, samas kui klorofüll B on lisapigment, mis kogub energiat ja läheb edasi klorofüllile A.
Klorofüll on looduslike pigmentide perekond, mida leidub taimedes ja vetikates ning mis vastutab nende rohelise värvi eest. Klorofüll neelab päikesevalguse energiat ja kasutab seda energiat vee ja süsinikdioksiidi süsivesikute sünteesimiseks. Fotosünteesiks nimetatud protsess toetab kõigi taimede eluprotsesse, kuna nende energiavajadus on selle protsessi kaudu täidetud. Lisaks on fotosüntees peamine protsess, mis toetab kõiki elusorganisme, kuna taimed on kõigi toiduahelate esmatootjad. Loomad ja inimesed tarbivad taimede tooteid. Klorofüllipigmentide perekonnas on mitut tüüpi klorofüllipigmente. Nende hulgas on klorofüll A ja klorofüll B kahte tüüpi klorofülleid. Neil on sarnane struktuur, porfüriinitsüklis on väike erinevus. Klorofüllil A on CH3 rühma porfüriinitsüklis, samal ajal kui klorofüllil B on porfüriinitsüklis CHO (aldehüüdirühm).
