Peamine erinevus prokarüootsete ja eukarüootsete ribosoomide vahel on see, et prokarüootsed ribosoomid on 70S osakesed, mis koosnevad 50S suurest ja 30S väikesest subühikust, samas kui eukarüootsed ribosoomid on 80S osakesed, mis koosnevad 60S suurest ja 40S väikesest subühikust.
Prokarüootid ja eukarüoodid on elusorganismide kaks peamist rühma, mis erinevad rakukorraldusest. Prokarüootidel puudub tuum ja membraaniga seotud raku organellid. Teiselt poolt on eukarüootidel tuum ja membraaniga seotud raku organellid. Mõlemal organismil on mõned ühised organellid. Ribosoom on üks olulisi ja elutähtsaid organelle, mis esinevad nii prokarüootsetes kui ka eukarüootsetes rakkudes. Need esinevad iga raku tsütoplasmas. Struktuurselt moodustavad valk ja ribosomaalne RNA (rRNA) koos ribosoomid. Ja need koosnevad kahest allüksusest, nimelt suuremast allüksusest ja väikesest allüksusest. Samuti täidavad nad sama funktsiooni, mis on mRNA molekulide translatsioon valkudeks. Kuna translatsioon on kõigi elusorganismide jaoks elutähtis protsess ja see toimub ribosoomides,ribosoomid on nii prokarüootide kui ka eukarüootide jaoks väga olulised. Vaatamata paljudele sarnasustele on prokarüootsete ja eukarüootsete ribosoomide vahel mõned erinevused.
