Peamine erinevus DNA vaktsiini ja rekombinantse vaktsiini vahel sõltub vaktsiinide valmistamisest. DNA vaktsiini valmistamiseks kasutatakse soovitud geene või DNA fragmente, rekombinantse vaktsiini valmistamiseks kasutatakse rekombinantset molekuli või vektorit, mis sisaldab soovitud geenifragmenti.
Vaktsineerimisi saab kasutada nii profülaktiliste ravimeetoditena kui ka infektsioonivastaste ravimitena. Vaktsineerimisi on palju. DNA ja rekombinantsed vaktsiinid on uusimad vormid. Pealegi on need vaktsiinid alles uurimise all.
