Põhiline erinevus primaarse ja sekundaarse kineetilise isotoobi efekti vahel on see, et primaarse isotoobi efekt kirjeldab purustatud sideme isotoopsubstitutsiooni, sekundaarne isotoopefekt aga purustatud sidemega külgneva sideme isotoopsubstitutsiooni.
Kineetiline isotoobi efekt ehk KIE viitab keemilise reaktsiooni reaktsioonikiiruse muutumisele isotoobi asendamisel. Siin asendatakse reaktiivis olev aatom oma isotoobiga, nii et reaktsioonikiirus oleks algsest kiirusest erinev. Seejärel saame määrata KIE väärtuse, jagades kerge isotoopselt asendatud reaktanti sisaldava reaktsiooni kiiruskonstandi rasket isotoopiliselt asendatud reaktanti hõlmava reaktsiooni kiiruskonstandist. Seetõttu peetakse KIE-d, mis on suurem kui 1, normaalseks kineetiliseks isotoopseks efektiks, vähem kui 1-d KIE-d aga pöördkineetiliseks isotoopseks efektiks.
