Peamine erinevus vahel intraspetsiifiliste ja liigisisene hübridisatsiooni et intraspetsiifiliste hübridisatsiooni toimub kahe seotud isikute kuuluvad kahte erinevasse liiki, samas kui liigisisene hübridisatsiooni vahel tekib geneetiliselt erinevad kaks inimest sama liigi.
Hübridiseerimine on geneetiliselt diferentseerunud isendite või rühmade paaritumise või ristamise protsess. Hübridiseerimise peamine eesmärk on ühendada erinevates organismides leiduvad soovitavad geenid. Veelgi enam, hübridiseerimist kasutatakse puhtalt paljunevate eellaste tootmiseks. Paaritumine võib toimuda kahe sama liigi isendi või kahe eri liigi isendi vahel. Sellest lähtuvalt on hübridisatsiooni kahte tüüpi: liigisisene hübridisatsioon ja liikidevaheline hübridisatsioon.
