Zonaalse kiiruse ja isopüknilise tsentrifuugimise peamine erinevus seisneb selles, et kiirusega tsooniline tsentrifuugimine on oluline osakeste eraldamisel, mis erinevad küll suuruse poolest, kuid mitte tiheduse poolest, samas kui isopükniline tsentrifuugimine on oluline osakeste eraldamisel, mis erinevad tiheduse, kuid mitte suuruse poolest.
Tsentrifuugimine on analüüsimeetod, mida saame kasutada lahuses osakeste eraldamiseks, lähtudes keskkonna suurusest, kujust, tihedusest, viskoossusest jne. Siin peame paigutama suspendeeritud osakesi sisaldava lahuse tsentrifugaaltorusse ja sisestama toru seejärel rootorisse, et pöörata seda kindlaksmääratud kiirusega, nii et osakesed lahusest eralduvad.