Peamine erinevus alloantikeha ja autoantikeha vahel on see, et alloantikeha on antikeha, mis on toodetud alloantigeenide vastu, mis on vereülekande või raseduse käigus sisestatud võõrad antigeenid. Samal ajal on autoantikeha antikeha, mis reageerib eneseantigeenidega.
Antikehad tekivad immuunvastuse tagajärjel. Need võivad peegeldada immuunvastuse olemasolu, olemust ja intensiivsust. Immuunsüsteem peaks suutma ise tuvastada antigeenid ja võõrad antigeenid. See on oma funktsiooni jaoks kriitiline. Immuunsüsteemi B-rakud toodavad antigeenide vastaseid antikehi. Alloantikehad ja autoantikehad on kahte tüüpi selliseid antikehi. Alloantikehad tekivad tänu alloantigeenide sissetoomisele organismi vereülekande või raseduse teel. Seevastu autoantikehad on antikehad, mis reageerivad eneseantigeenidega. Autoantikehade reaktsioon eneseantigeenidega põhjustab kudede ja elundite põletikku, kahjustusi ja talitlushäireid, mis viib autoimmuunhaiguste tunnuste ja sümptomiteni.
